黑色素瘤又称为恶性黑色素瘤,主要是来源于黑色素细胞的一种高度恶性肿瘤,具有高度异质性和可变性。大量证据表明,黑色素瘤细胞能够表示为黑色素细胞(增殖性)或间充质样(侵袭性)等细胞转录状态。scRNA-seq剖析证明了这两种细胞状态能够共存。但是,来自体内、体外模型的最新研讨表明,可能存在其他状态的黑色素瘤细胞,也就是说人们目前对黑色素瘤瘤内异质性的了解可能是不完好的。这些察看到的证据也提出了一种可能性,即这些不同的细胞状态对肿瘤生长和转移扩散的贡献可能是不同的。因而,有必要进一步深化研讨黑色素瘤的表型异质性。 重新探求黑色素瘤细胞状态的多样性 基于携带Tyr::NrasQ61K/o等位基因和缺乏Cdkn2a(也称Ink4a或p16INK4a)的小鼠模型,研讨人员发现这些小鼠发作皮肤单克隆黑色素瘤病变,并随后向淋巴结、肝和肺转移。为了增加该模型的多功用性,研讨人员在C57BL/6小鼠中衍生出同基因细胞系,并用scRNA-seq评价了这类黑色素瘤病变的转录组图谱。应用已发表的细胞类型特异性基因集,研讨人员审定出T细胞、B细胞、癌症相关成纤维细胞(fibroblast)、树突状细胞(dendritic cell)、单核细胞/巨噬细胞(monocyte/macrophage)、内皮细胞 (endothelial cell,EC)、周细胞(pericyte)和恶性细胞群,表明了肿瘤微环境的复杂性。进一步对恶性细胞群中止剖析,经过无监视聚类和UMAP剖析,辨认了7种不同的黑色素瘤细胞状态(图1a)。 MITF是黑色素瘤分化状态的关键调理因子。研讨人员在一切恶性细胞中均检测到普遍的Mitf转录活性,但相对地,增殖性细胞的MITF活性最高,浸润性细胞的最低。研讨人员察看到来自簇4的细胞表示出最低的MITF活性,表明该簇细胞是一切恶性细胞中去分化水平最高的(图1b)。 研讨人员运用基因汇合富集工具对每个聚类中止功用注释,并树立了每个这些簇的基因表白特征(图1c、d),运用AUCell计算不同细胞的预测值,并将其映射到UMAP空间(图1e),结果显现,这些细胞呈现了前表皮间叶细胞过渡(pre-epithelial–mesenchymal transition,pre-EMT)的踪迹,这些细胞是第一个以胚胎方式呈现的神经嵴(neural crest,NC)定向细胞,并构成了一个自我更新的NC干细胞池(图1f)。此外,scRNA-seq剖析显现,在这些病变中,可辨认出具有黑色素细胞、间充质样、NC样和pre-EMT NC茎样特征的黑色素瘤细胞。 黑色素瘤的细胞层次结构 为了确认这些原发性黑色素瘤能否具有分层结构,研讨人员运用多色Rosa26-LSL-Confetti等位基因的可诱导遗传谱系追踪措施,发现Tyr::NrasQ61K/°;Ink4a/;Tyr::creERT2/°;Rosa26-LSL-Confetti+/+复合小鼠大约在8±2个月龄时呈现原发性黑色素瘤病变(图2a)。当原发病变的肿瘤片段被移植到C57BL/6小鼠后,病变呈指数式稳步增长(图2b),且在组织学上无法与原瘤组织分辨。经切片检查,研讨人员发现有一个小克隆明显增大,扩展了数十个细胞,相比之下,大多数其他克隆仍很小(图2c)。 接下来,研讨人员运用了基于密度的检测措施,以单细胞分辨率连续重建和评价总克隆大小(图2d),在此发现一切肿瘤样本中克隆大小都存在显著差别(图2e),进一步的证据展示了克隆大小积聚散布的双峰行为(图2f)。这种行为与层次增殖分歧,干细胞样种群经过细胞复制随机扩展,同时产生第二种祖细胞样状态,后者又经过细胞复制扩展(图2g)。为了检查肿瘤生长的增殖动力,研讨人员运用5-乙基-2’-脱氧尿苷(EdU)和溴脱氧尿苷(BrdU)来标记细胞(图2h),发现肿瘤的生长是由细胞以相似的迟缓平均速率随机团结来维持的(图2i)。 综上表明,原发性黑色素瘤具有层次结构,包含至少两个表示出不同生长动力学和命运转为的细胞群——干细胞样和祖细胞样群,干细胞的特性与空间定位的环境有关。 |